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上海生科院受邀发表Alu序列调控功能综述文章

归档日期:05-27       文本归类:反向信道      文章编辑:爱尚语录

  2月10日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲与计算生物学研究所研究员杨力受邀在《细胞生物学趋势》(Trends Cell Biol)发表了题为ALUternative Regulation for Gene Expression 的综述论文,系统总结了灵长类(包括人)基因组中特异的Alu短散在核重复序列(short interspersed nuclear elements)基因表达过程中的重要调控作用。

  45%的人类基因组序列由转座子来源的序列构成,其中很重要的一部分是短散在核重复序列(short interspersed nuclear elements, SINE)。在包括人在内的灵长类基因组中存在一类特殊的SINE序列——Alu序列,其约300 bp长。其中,人类基因组中包含了超过一百万个Alu序列,占据了人类基因组超过11%的序列构成。Alu等重复序列在前期通常被认为是无用的“垃圾”序列,但是随着研究的深入,大量的证据表明Alu无论是在基因组进化(DNA和转录调控水平),还是在遗传信息的多样性(表观遗传调控和RNA水平)方面都发挥重要的调控作用。有意思的是,Alu序列可以通过RNA Polymerase III独立转录,或者是通过RNA Polymerase II共转录,产生各色各样的RNA分子并发挥重要的基因表达调控作用,例如,大量存在于内含子的Alu序列可以通过反向互补形成RNA配对结构(inverted repeated Alu sequences, IRAlus)调控环形RNA的生成加工,而人基因组中所蕴含的大量特殊Alu序列则是环形RNA在人中高表达的主要原因之一。发表在Trends Cell Biol 上的这一特邀综述论文,主要对上述多种Alu序列的重要调控新功能进行了总结和展望。

  相关研究获得了中科院、科技部、国家自然科学基金委以及上海市科委等的经费支持。

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